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第40卷 第1期(2020年1月): 1-7

 

CRISPR-Cas13系统与活细胞RNA标记

杨良中,王 洋,陈玲玲*

(分子生物学国家重点实验室,中国科学院分子细胞科学卓越创新中心,上海市分子男科学重点实验室,中国科学院生物化学与细胞生物学研究所,中国科学院大学,上海 200031)

 

摘要  在活细胞条件下观察RNA分子的亚细胞定位和动态变化对了解它们的功能十分重要,而目前活细胞RNA标记的工具十分有限。中国科学院生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲研究组的最新研究成果成功利用CRISPR-Cas13系统实现了在活细胞中对RNA的特异性标记。研究人员筛选出了RNA标记能力较强的dPspCas13b和dPguCas13b蛋白,优化后可以有效标记非编码RNA和mRNA,进一步联合使用dPspCas13b和dPguCas13b蛋白实现了对活细胞内不同RNA的双色标记,与标记DNA的CRISPR-dCas9系统联用实现了RNA转录和基因位点的同时标记。该工作为在活细胞中研究RNA的定位、不同RNA之间的相互关系、DNA与RNA转录调控的关系提供了简单有效的新手段。

 

关键词  CRISPR-dCas13;paraspeckles;NEAT1;SatIII;MUC4;GCN4;RNA动态变化;双色标记

 
中国科学院战略性先导科技专项B类项目(XDB19020104);国家科技部重点研发计划项目(2016YFA0100701);国家自然科学基金项目(31725009,31830108,31821004,31861143025);霍华德休斯医学研究所国际科学家支持计划项目(55008728)
 

*通讯作者。E-mail: linglingchen@sibcb.ac.cn

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